齐鲁网·闪电旧事3月24日讯近日，中国海洋大学水产学院高勤峰传授团队，结合山东海洋集团无限公司和华智生物手艺无限公司，操纵cGPS靶向测序分型手艺研发了我国首款虹鳟SNP育种芯片——“虹芯1号”（图1）。这是我国目前虹鳟育种范畴独一具有自从学问产权的行业公用芯片，意味着国产虹鳟育种芯片自从攻关实现主要冲破，为虹鳟精准育种取财产高质量成长注入“芯”动力。虹鳟（Oncorhynchus mykiss）附属于鲑科，承平洋鲑属，是全球主要的养殖经济鱼类（图2）。我国自1959年从朝鲜引入虹鳟以来，其养殖财产逐渐兴起，并正在60余年间敏捷成长，目前养殖地域遍及12个省份，年产量约为4万吨。近年来，我国工场化轮回水养殖设备和大型钢布局深近海养殖网箱的设想取建制取得环节手艺冲破，为海水养殖虹鳟财产规模化成长供给了配备根本。目前我国虹鳟养殖财产的优秀种质资本严沉依赖美国、丹麦和挪威等国度，其苗种均以“全雌三倍体”的形式出售，种源被严酷节制，限制着我国鲑鳟鱼类海水养殖财产的规模化成长。操纵高效的现代育种手艺和东西，快速培育优良的虹鳟苗种成为冲破我国鲑鳟鱼类良种匮乏“卡脖子”难题的环节。基因组选择育种是一种操纵笼盖全基因组的高密度标识表记标帜进行遗传选育的新方式，具有周期短、目前已被使用至很多主要水产经济的良种选育研究工做，其选育结果显著优于保守的群体选育和家系选育手艺。鲑鳟鱼类因为履历了性的第四次全基因组复制事务，导致其基因组大小约为通俗硬骨鱼类的2倍至4倍，由此发生的昂扬测序费用和庞大计较资本耗损，成为鲑鳟鱼类基因组选择育种工做普遍开展的主要要素。育种芯片是主要的现代育种东西，可对种质资本海量SNP位点进行快速、精确的分型检测，而且具有较低的单元检测成本。世界第一款虹鳟育种芯片由USDA美国农业部于2014年开辟，共包含57，501个SNP位点，然而因为其时的手艺，导致芯片中含有约20，000个SNP位点冗余，影响了其分型效率。2021年，法国国度农业研究院发布了世界第二款虹鳟SNP育种芯片（667K），其位点的遗传消息来自于美国农业部和法国国度农业研究院的公共数据库以及俄罗斯和的虹鳟繁育和野生群体。因为芯片位点密渡过高且针对于欧美的虹鳟野生和繁育群体研发，对亚洲虹鳟繁育群体的合用性较差，了其正在我国虹鳟科学研究的使用。“虹芯1号”液相育种芯片同时兼顾了国表里虹鳟繁育和野生群体的遗传消息，共有51，508个高质量SNP位点，此中，国内虹鳟繁育群体来自山东、辽宁、甘肃临夏、四川和新疆博乐等地域，国外虹鳟的遗传消息则由美国、、挪威、丹麦、“虹芯1号”液相芯片使用场景丰硕，可同时满脚国表里虹鳟野生和繁育群体的种质资本判定、遗传多样性评估、全基因组选择育种、全基因组联系关系阐发和遗传图谱建立等多方面研究工做的需求，有帮于其主要经济性状遗传根本的解析取优异基因资本的挖掘。